Osnovni podatki projekta

Naslov:

Molekularno genetski biooznačevalci in mehanizmi neodzivnosti na biološko zdravljenje z anti-TNF bolnikov s kroničnimi imunskimi boleznimi

Vodja projekta:

prof. dr. Uroš Potočnik (Medicinska fakulteta Univerze v Mariboru)

Sodelujoči iz MF UM:

asist. dr. Tomaž Budefeld, doc. dr. Helena Sabina Čelešnik, izr. prof. dr. Jernej Dolinšek, dr. Boris Gole, izr. prof. dr. Mario Gorenjak, asist. dr. Larisa Goričan, red. prof. dr. Radovan Hojs, asist. dr. Gregor Jezernik, asist. dr. Staša Jurgec, red. prof. dr. Ivan Krajnc, Martina Krušič, red. prof. dr. Nataša Marčun Varda, dr. Martina Marič, red. prof. dr. Dušica Pahor, dr. Maya Petek, red. prof. dr. Uroš Potočnik

Trajanje:

2022-2024

Iz vsebine

Kratek opis:

Projekt temelji na celoviti analizi podatkov iz različnih omik, ki zajemajo genomiko (NGS, genotipizacija), transkriptomiko (RNAseq), proteomiko, epigenomiko (modifikacije DNA in histonov) in regulatorne procese (profili nekodirajočih RNA, variante izrezovanja). Z uporabo naprednih bioinformatskih metod bomo te podatke integrirali in jih korelirali s kliničnimi izidi.

 
Vloga MF:

Integracija genetskih (NGS, genotipizacija), ekspresijskih (RNAseq), proteomskih, epigenetskih (DNA in histonska modifikacija) in regulatornih (profili ne‐kodirajoče RNA, variante izrezovanja) podatkov zbioinformatskimi orodji (genska ontologija ‐ GO) in povezava s kliničnimi podatki.