|
Kratek opis:
Raziskali bomo molekularne mehanizme, ki prispevajo k
neodzivnosti bolnikov s kroničnimi imunskimi boleznimi kot sta Crohnova
bolezen in revmatoidni artritis, na anti‐TNF terapijo in odkrili
molekularno genetske biooznačevalcev, ki bi lahko napovedali odziv na
anti‐TNF terapijo in bi bili uporabljeni za personalizirano
zdravljenje.
Vloga MF:
Integracija genetskih (NGS,
genotipizacija), ekspresijskih (RNAseq), proteomskih, epigenetskih (DNA
in histonska modifikacija) in regulatornih (profili ne‐kodirajoče RNA,
variante izrezovanja) podatkov zbioinformatskimi orodji (genska
ontologija ‐ GO) in povezava s kliničnimi podatki.
Faza realizacije:
Projekt je uspešno zaključen! Zastavljeni cilji so bili v celoti doseženi.
Izbrane reference:
Članki v znanstvenih revijah s faktorjem vpliva SCI:
GORENJAK, Mario, ZUPIN, Mateja, JEZERNIK, Gregor, SKOK, Pavel,
POTOČNIK, Uroš. Omics data integration identifies ELOVL7 and MMD gene
regions as novel loci for adalimumab response in patients with Crohnʼs
disease. Scientific reports, ISSN 2045-2322, 2021, vol. 11, str. 1-12,
ilustr. https://www.nature.com/articles/s41598-021-84909-z,
https://doi.org/10.1038/s41598-021-84909-z, doi:
10.1038/s41598-021-84909-z. [COBISS.SI-ID 54882051],
JEZERNIK, Gregor, MIČETIĆ-TURK, Dušanka, POTOČNIK, Uroš. Molecular
Genetic Architecture of Monogenic Pediatric IBD Differs from Complex
Pediatric and Adult IBD. Journal of personalized medicine, ISSN
2075-4426, 2020, vol. 10, iss. 4, str. 1-18, ilustr.
https://www.mdpi.com/2075-4426/10/4/243, doi: 10.3390/jpm10040243.
[COBISS.SI-ID 39713283]
GOLE, Boris, POTOČNIK, Uroš. Pre-treatment biomarkers of anti-tumour
necrosis factor therapy response in Crohn's disease : a systematic
review and gene ontology analysis. Cells, ISSN 2073-4409, June 2019,
vol. 8, iss. 6, str. 1-21. https://www.mdpi.com/2073-4409/8/6/515, doi:
10.3390/cells8060515. [COBISS.SI-ID 512899384],
AVBELJ, Monika, HAFNER BRATKOVIČ, Iva, LAINŠČEK, Duško, MANČEK KEBER,
Mateja, PETERNELJ, Tina Tinkara, PANTER, Gabriela, TREON, Steven P.,
GOLE, Boris, POTOČNIK, Uroš, JERALA, Roman. Cleavage-mediated
regulation of Myd88 signaling by inflammasome-activated caspase-1.
Frontiers in immunology, ISSN 1664-3224, Jan. 2022, vol. 12, str. 1-14,
ilustr.
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fimmu.2021.790258/full,
https://doi.org/10.3389/fimmu.2021.790258, doi:
10.3389/fimmu.2021.790258. [COBISS.SI-ID 93261315],
GORENJAK, Mario, REPNIK, Katja, JEZERNIK, Gregor, JURGEC, Staša, SKOK,
Pavel, POTOČNIK, Uroš. Genetic prediction profile for adalimumab
response in Slovenian Crohn's disease patients = Genetisches
Vorhersageprofil für die Adalimumab-Antwort bei den slowenischen
Morbus-Crohn-Patienten. Zeitschrift für Gastroenterologie, ISSN
0044-2771, Okt. 2019, jahrg. 57, hft. 10, str. 1218-1225, ilustr.
https://www.thieme-connect.com/products/ejournals/abstract/10.1055/a-0981-6516,
doi: 10.1055/a-0981-6516. [COBISS.SI-ID 6817599],
Doktorska naloga:
JEZERNIK, Gregor. Biološki procesi in napovedovanje neodzivnosti na
zaviralce dejavnika tumorske nekroze pri Crohnovi bolezni z integracijo
genomskih podatkov : doktorska disertacija. [S. l.: G. Jezernik], 2021.
X, 104 str., ilustr. https://dk.um.si/IzpisGradiva.php?id=77986.
[COBISS.SI-ID 47827971]
|
